Bioinformaticus Genoomdiagnostiek

Bioinformaticus genoomdiagnostiek Vragen? ?- Facebook Twitter LinkedIn WhatsApp Email Copy Link

• Aantal uur:

  36 uur per week

• Werklocatie:

  Beide locaties Amsterdam UMC

• Contractvorm:

  bepaalde tijd met uitzicht op vast

• Salaris:

  € 3.514 - € 4.817

• Reageer tot en met:

  18 maart 2024

Wat ga je doen?

Als bioinformaticus ben jij het eerste aanspreek punt en verantwoordelijk voor de data verwerking van de genetische data die wordt ingezet voor de patiënten diagnostiek. Jij voert data analyse pipelines uit, zowel handmatig als geautomatiseerd, en zorgt voor tijdige rapportage aan lab specialisten en klinisch genetici. Daarnaast ben je verantwoordelijk voor de kwaliteit van de bioinformatica processen. Je ontwikkelt automatiseringsprocessen & data analyse pipelines en verzorgt de kwaliteitsborging middels documentatie, validatie, verificatie & standard operating procedures (SOP) volgens ISO 15189 en IEC-62304 norm.

Vragen over deze functie? Wat neem je mee?

Je hebt een afgeronde opleiding in de bioinformatica, IT of life sciences 

Je hebt kennis en ervaring met Python  

Je bent bekend met kwaliteitssystemen en ISO normeringen 

Je bent bereid te werken met Linux en High Performance Compute omgevingen 

Je bent een behulpzame teamplayer en vindt patientendiagnostiek belangrijk 

Wat bieden we jou?

• Een jaarcontract met uitzicht op een vast contract.
• Inschaling in salarisschaal 9: € 3.514 tot € 4.817 bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring). Daarnaast ontvang je onder andere 8,3% eindejaarsuitkering en 8% vakantietoeslag. .
• Gratis en onbeperkt toegang tot onze online leeromgeving GoodHabitz.
• Pensioenopbouw bij het ABP, waarvan wij 70% van de premie betalen.
• Een (gedeeltelijke) vergoeding van je OV-reiskosten. Kom je liever op de fiets? Dan hebben we een goede fietsregeling.
• Een actieve personeelsvereniging én Jong Amsterdam UMC vereniging, die beide leuke (sportieve) activiteiten en evenementen organiseren.

Waar ga je werken?

Je komt te werken bij het laboratorium Genoom Analyse van de afdeling Humane Genetica. Binnen het laboratorium maak je onderdeel uit van het team bioinformatica. Het bioinformatica team ontvangt en verwerkt grote hoeveelheden Next Generation Sequencing data. De bulk van deze data bestaat uit short read sequencing data (Illumina NovaSeq en de NextSeq serie), maar ook uit long read sequencing data (Oxford Nanopore P2 solo, Pacific Biosciences Sequel IIe) en optical genome mapping data (Bionano Syphyr). Voor de verwerking van de data maken beschikken we over ons eigen High Performance Compute (HPC) cluster met 1500+ CPU / GPU cores. 

Het team bioinformatica vervult de brug functie tussen de life sciences en data sciences en bestaat momenteel uit een divers gezelschap van 6 werknemers die zowel ontwikkel als beheer werkzaamheden op zich nemen. Het team verzorgt de routine data verwerking voor diagnostiek & research en is verantwoordelijk voor de ontwikkeling & beheer van analyse pipelines, informatie systemen, HPC infrastructuur en data management. Het team maakt onderdeel uit van het diagnostisch lab en onderhoudt korte lijnen met analisten om de lab processen optimaal te kunnen ondersteunen. Tevens maakt het team onderdeel uit van de Core Facility Genomics waarin we de data processing, data management en HPC infrastructuur verzorgen voor de onderzoekers van het Amsterdam UMC en samenwerkingspartners.  

De cultuur is open en de samenwerking over het algemeen laagdrempelig. Bovendien streven we naar gelijke kansen voor iedereen. Dat betekent dat er ruimte is voor een ieders cultuur, afkomst, ideeën en creativiteit. .Wat kun je verwachten? Een baan in onze prachtige hoofdstad Werken bij dé favoriete werkgever in de zorg (intermediair 2021) Alle collega's hebben hetzelfde doel: bijdragen aan de zorg voor morgen Er is ruimte voor ontplooiing, verdieping en verbreding van je kennis Een actieve personeelsvereniging die leuke activiteiten organiseert en korting op producten en diensten voor jou regelt Amsterdam UMC innoveert continu, dat vraagt om een flexibele instelling van iedereen Twee grote locaties, goed voor je stappenteller! Je hebt meer dan 19000 collega's die je niet allemaal persoonlijk zult leren kennenHet verhaal van Amsterdam UMC Amsterdam UMCTulpVerpleegkundige visie Laten we kennis maken

Heb je nog vragen? Voor inhoudelijke informatie kun je terecht bij

Voor meer informatie over de sollicitatieprocedure kun je terecht bij

Een referentiecheck en screening kunnen onderdeel zijn van de procedure. Kom je bij ons in dienst, dan vragen we voor een aantal functiegroepen standaard een VOG (Verklaring Omtrent Gedrag). Lees 

hier

 wat dit inhoudt en of het voor jouw functie van toepassing is.

Interne kandidaten krijgen, bij gelijke geschiktheid, voorrang op externe kandidaten.

Deze vacatures vind je misschien ook leukProject Klinisch Chemicus Laboratorium • bepaalde tijd • 32 - 36 uur Kwaliteitsfunctionaris Pathologie Laboratorium • bepaalde tijd met uitzicht op vast • 32 - 36 uur Wil je mee bouwen aan de afdeling pathologie? Onze afdeling is volop in transitie en verhuist de komende jaren naar een nieuw laboratorium. Wij bieden...

https://werkenbij.amsterdamumc.org:443/